ЗАКОН "О НЕДРАХ" от 21.02.1992 № 2395-1

Касаемо скважин на воду:

Статья 19. Добыча общераспространенных полезных ископаемых собственниками земельных участков, землепользователями, землевладельцами и арендаторами земельных участков
(в ред. Федерального закона от 26.06.2007 N 118-ФЗ)

Собственники земельных участков, землепользователи, землевладельцы и арендаторы земельных участков имеют право, по своему усмотрению, в их границах осуществлять без применения взрывных работ добычу общераспространенных полезных ископаемых, не числящихся на государственном балансе, и строительство подземных сооружений для своих нужд на глубину до пяти метров, а также устройство и эксплуатацию бытовых колодцев и скважин на первый водоносный горизонт, не являющийся источником централизованного водоснабжения, в порядке, устанавливаемом соответствующими органами исполнительной власти субъектов Российской Федерации.

Органы исполнительной власти субъектов РФ- это департаменты, комитеты, управления (в каждой области, крае, республике по разному).
Например в Ярославской области таковым органом является департамент охраны окружающей среды и природопользования.
Постановление Правительства области от от 14 апреля 2010 г. N 198-п